一、氨基酸的结构特点
(1)天然蛋白质中的氨基酸均为L-型(除Gly,不具手性碳)。
(2)相同的结构通式。
(3)不同氨基酸的侧链R基不同,R基决定了氨基酸的性质。
(4)氨基酸是极性分子,在溶液中是兼性离子,一般都溶于水。
二、氨基酸的分类
按侧连R基结构分类
氨基酸分为脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、杂环族氨基酸。
注意以下特点:
支链氨基酸:缬氨酸、亮氨酸,异亮氨酸(含β-手性碳)。
含羟基氨基酸:丝氨酸、苏氨酸(含β-手性碳,-OH可连糖链)。
含硫氨基酸:半胱氨酸(含巯基,高活性)、甲硫氨酸(可作甲基供体)。
含苯环氨基酸:苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸(280nm吸收,Trp最强)。
含咪唑基氨基酸:组氨酸(弱碱性,接近生理pH,唯一具有缓冲能力的氨基酸)。
亚氨基酸:脯氨酸(刚性,易形成β-转角)。
含酰胺基氨基酸:天冬酰胺、谷氨酰胺。
酸性氨基酸:谷氨酸(含γ-羧基)、天冬氨酸(含β-羧基)。
碱性氨基酸:精氨酸(含胍基,碱性最强)、赖氨酸(含ε-氨基)、组氨酸。
按侧连R基极性分类:
分为极性R基氨基酸、非极性R基氨基酸(侧链无极性)。
按参与蛋白质构成分类:
基本氨基酸:天然氨基酸,有编码,20种常见(61个密码子编码)+2种不常见(Sec、Pyl,由2个终止子在特殊情况下编码)。
稀有氨基酸:由基本氨基酸修饰而来。
非蛋白质氨基酸:迄今发现约150种,存在于生物体内,但不构成蛋白质,如D-氨基酸。
按营养需求分类:
必需氨基酸、非必需氨基酸、半必需氨基酸。
特别提示:
甘氨酸是唯一不含手性碳原子的氨基酸,不具旋光性,甘氨酸的侧链介于极性与非极性之间。
三、氨基酸在蛋白质中的分布
非极性氨基酸一般形成蛋白质的疏水核心,而带电荷氨基酸和极性氨基酸位于蛋白质分子表面。比如:
非极性氨基酸Val、Pro、Phe、Ile、Leu多分布于分子内部;
极性氨基酸Asp、Lys、His多位于分子外部;
疏水性和极性较小的氨基酸Ala、Gly,侧链较小,可内可外或转角处;
不带电、极性侧链氨基酸Asn、Gln、Ser、Thr,可参与氢键而减少极性,可内可外;
不带电、极性、含有巯基氨基酸Cys可参与形成二硫键,可内可外。
四、氨基酸名称缩写
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